建造师在对“挂证”行为进行专项治理时，通常会核查其个人所得税。这也可能涉及建造师的税务申报和扣除等问题。如果在自查自纠的过程中，发现注册单位与个人所得税缴纳单位不符，但实际上并不存在“挂证”现象，应及时与注册单位以及个人所得税缴纳单位进行沟通协调。同时，要准备好相关证明材料，如劳动合同、工资流水和工作证明等，说明情况并进行整改，确保个人所得税的缴纳情况与注册单位一致。

如果在排查处理阶段发现个人所得税缴纳单位与注册单位不符，首先需积极配合主管部门的调查，如实地提供相关材料并说明情况。如果能够证明这种不一致是由于单位的改制、合并或分立等客观原因所致，则需提供相应的文件和证明材料；如果确实存在“挂证”等违规行为，应接受主管部门的处罚，按照要求注销违规注册，并在规定期限内不得重新申请注册。

自查阶段

确认申报状态：请登录个人所得税APP，检查是否存在未完成的申报记录。如果有，请尽快按照系统提示进行申报。

核实收入信息：认真核对工资、劳务报酬等各类收入明细，以确保金额的准确性。如果发现有未申报或申报错误的收入，需及时进行更正或补充申报。

核对专项附加扣除：仔细检查子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人等专项附加扣除项，确保其填写正确并已享受相关优惠。如果发现遗漏或错误，需及时进行修改或补充相关扣除信息。

比对阶段

与社保和公积金缴纳单位进行比对：将个人所得税的扣缴单位与社保和公积金的缴纳单位进行核对，以确保三者的一致性。如果发现不一致的情况，需要进一步确认原因，例如是否存在挂靠、兼职等特殊情况导致的差异。

与实际工作单位进行对比：确认个人所得税的扣缴单位是否为当前实际工作单位。如果不是，可能存在挂靠等问题，应及时向有关部门说明情况，并按照规定办理注销或变更手续。

申诉及处理阶段

申诉流程：如认为个人所得税的审核结果有误或不合理，可以向所在地的税务机关提出申诉。在申诉时，需准备充分的证据和合理的说明，以证明自己的纳税情况符合相关法律法规的要求。

配合调查：主动支持税务机关的调查工作，如实地提供相关资料和信息。根据调查结果，税务机关将作出相应的处理决定，例如补缴税款、调整申报信息或给予行政处罚等。