建造师证书不能单方面注销，需要建造师和企业方面的系统配合提交后等待审核，审核完成后下一步就是公示阶段，最后注销成功，如果企业方面不支付费用是很严重的问题，企业拖欠劳务工资是可以走起诉或者仲裁流程的。建造师如果想单方面注销也就是强制注销，住建部门是需要看到劳动局或者法院相关文书才能强制注销。

如果您的建造师证书挂靠在某个单位，而该单位没有按照约定支付报酬，您可能希望通过注销注册来解决问题。根据相关规定和实践情况，可以尝试以下步骤自行申请注销。

1、尝试沟通：首先尝试与挂靠单位进行沟通，说明情况并要求配合办理注销手续。

2、自行申请注销：如果沟通无果，您可以登录中国建造师网或当地建设行政主管部门指定的系统，按流程自行申请注销注册。通常需要填写相关申请表格，并提交必要的证明文件。

3、法律途径：如果挂靠单位拒绝配合，您可以通过法律手段维护自己的权益。这包括收集未支付工资的相关证据（如合同、银行流水等），向劳动监察部门投诉或者直接提起劳动仲裁乃至诉讼。

4、挂失补办：作为最后的手段，如果您无法通过上述方法解决问题，可以考虑将您的证书挂失并申请补办新证。不过，这个过程可能会比较复杂且耗时，而且可能不会完全解决所有问题。

需要注意的是，挂靠行为本身是违反相关法律法规的，因此在处理此类问题时务必谨慎行事，并尽可能寻求合法合规的方式来解决问题。同时，考虑到政策会随时间变化，建议咨询最新的地方性法规或联系相关部门获取最新指导。